十年前，一场几乎毁灭世界的大灾难席卷冬木市。在这场浩劫中，卫宫士郎被魔术师卫宫切嗣救出并收为养子。十年后，为了履行与已故养父之间的约定——成为“正义的伙伴”，士郎日复一日地进行着魔术锻炼。尽管他缺乏魔术天赋，却依然坚守着这份信念。偶然的一天，士郎意外被卷入了魔术师之间的殊死对决——“圣杯战争”。这场仪式的规则是：七位由圣杯选出的魔术师（御主 Master）将与七位历史英雄之魂（英灵 Servant）结成契约。传说中，圣杯是能实现持有者任何愿望的许愿机，而唯一胜出的一组人马，方能获得这至高无上的权力。于是，七位御主与七位英灵共同投身于这场为了创造奇迹而展开的血腥厮杀之中。卫宫士郎深知，十年前的那场大灾难正是由“圣杯战争”所引发。为了阻止悲剧再次上演，在被致命攻击威胁生命的危急关头，他与现身拯救自己的剑士英灵——Saber结下了契约。自此，这对被命运相连的御主与从者，携手踏上了这条充满危险与艰辛的征战之路。