战国时代，以恐怖统治天下的最凶恶武将“牙鬼幻月”，被由“伊贺崎家”率领的忍者众历经激战后打倒。然而，牙鬼幻月却留下了不祥的预言：“444年后，我将化作妖怪复活，再次以恐怖支配天下！”时光流转，末代忍者“伊贺崎好天”与复活的妖怪牙鬼幻月展开决斗，并成功将其封印。岁月再次流逝至现代——牙鬼幻月的封印意外解除。其怨念衍生出大批妖怪，并组成邪恶的“牙鬼军团”。为了让首领完全复活，妖怪们四处搜集人类的恐惧之心，开始向无辜的人们展开袭击！紧急时刻，五位年轻人挺身而出。他们正是伊贺崎家的末裔，也是末代忍者·伊贺崎好天的孙子们！秉持着“当忍则忍，可不忍则不忍！”的信念，三代同堂的羁绊就此点燃。他们怀揣着火热的“忍者心”（Nintality），施展各种异想天开的忍术，漂亮地击退来袭的妖怪！为了继承祖父“末代忍者”的封号，也为了彻底粉碎妖怪军团让牙鬼幻月复活的野心，他们不仅选择不忍，更要向邪恶大肆反击！